Специалист по молекулярному моделированию / Структурный биоинформатик

Описание

Команда учёных в области медицинской геномики ищет специалиста по молекулярному моделированию и вычислительной структурной биологии. Вам предстоит решать как фундаментальные задачи по интерпретации генетических мутаций, так и прикладные R&D-задачи по дизайну и оптимизации терапевтических белков и пептидов. Обязанности: Проведение белок-белкового и белок-лигандного докинга (преимущественно пептиды, в меньшей степени – малые молекулы), моделирование белков в растворе и в мембране. Структурный анализ и интерпретация влияния миссенс-мутаций на функцию белков в рамках биомедицинских проектов отдела по поиску генетических основ патогенеза заболеваний. Дизайн белков с заданной функцией, оптимизация пептидных препаратов и терапевтических конструкций, деиммунизация белковых носителей. Требования: Профильное высшее образование (биоинформатика, биофизика, молекулярная биология, химия/вычислительная химия или смежные специальности). Опыт работы с программным пакетом GROMACS (или аналогичными инструментами для молекулярной динамики). Навыки проведения молекулярного докинга (белок-белковый, пептидный, белок-лигандный). Знание современных ML-инструментов структурной биологии (ProteinMPNN, AlphaFold / ESMFold и др.) и готовность применять их для дизайна белков de novo. Дополнительным преимуществом будет знание классических ML-инструментов и возможность их применения к структурным данным. Опыт визуализации структурных данных и подготовки графики для научных отчетов и публикаций. Понимание основ биомедицины, готовность работать на стыке вычислительных методов и экспериментальной биологии. Условия: Гибридный график работы после испытательного срока. Стабильная заработная плата по рынку и выше (обсуждается на собеседовании). Оформление по ТК РФ. Комфортный офис в 10 минутах от м. Щукинская.